脐橙萌发力、成枝力强，但枝梢纤细，坐果率低。针对这一特性，对各类枝梢采取不同的修剪。同时，修剪脐橙果树的目的就是使果树丰产，和提高果品商品、精品率。不像其它一些园艺作物一样要追求树体的美观造型。要求树体是：树体牢固高大、强壮旺盛，树枝主副有序，无病虫枝叶，枝叶稀密合理、分布均衡、层次分明。种植脐橙可以参考以下方法进行修剪：
一、脐橙幼树修剪方法：
以培养树冠为主，宜轻剪，避免过多的疏剪和重短截。
在苗木定干的基础上，第1年和第2年培养主枝，选留副主枝和侧枝；第3年培养主枝和副主枝的延长枝，合理布局侧枝群。适当疏删过密枝梢，内膛枝和树冠中下部较弱的枝梢一般均应保留。9月10日以后抽发的晚秋梢全部剪除。
二、脐橙初结果修剪方法：
继续培育扩展树冠，选择和短截修剪各级骨干枝的延长枝，适量结果。回缩或短截结果后的枝组。对过长的营养枝留15～25厘米摘心。
每次放梢前抹除早期零星萌发的芽，达到整齐放梢。
末次秋梢要在8月中下旬放齐，9月10日以后抽发的晚秋梢全部剪除。轻剪为主，避免过多的疏剪和重短截。适当疏删过密枝梢，对扰乱树形的徒长枝和直立枝从基部剪除。注意利用徒长枝，通过拉枝、短截修剪以填补树冠空缺。
三、脐橙树盛果期修剪方法：
保持生长与结果的相对平衡，树高一般控制在3米以下，绿叶层厚度1米左右，树冠覆盖率75％～85％。及时回缩结果枝组、落花落果枝组和衰退枝组。
剪除枯枝、病虫枝，疏删丛生枝。对骨干枝过多和树冠郁闭严重的树，采用大枝修剪法从基部剪除过密或位置不当的大枝，保持通风透光。
多花树以疏删花枝、纤弱枝为主，上年秋梢结果母枝截至基部促发新梢，疏删与短截结合。少花旺树轻剪，仅删除部分直立营养枝，以利于结果。
