金针菇栽培中传统的刺激出菇方法是搔菌。此法易使菇的生长高低不齐，枝数少，柄粗，产量和质量均不理想。采用再生枝栽培法，不仅菇密，柄细，高矮一致，而且外观好，比传统方法品质提高1-2个等级，产量提高10％以上。
再生枝栽培法，就是当菌丝发透菌袋5天后，将栽培袋从全暗培养室取出，移入有散射光的栽培室内。室温控制在15℃。7天后，袋内培养基表面分泌出黄褐色细小水珠，随之出现丛状细长幼菌蕾，伞盖很小，菇体像豆芽。此时不要急于开袋出菇。当袋内幼菇长至3-5厘米，呈不规则弯曲下垂时，弃掉棉栓及环套，袋口拉直并向外翻折下与料面平，开门窗通风降低菇房内空气相对湿度至70％，使豆芽菇枯萎。经2-3天，原豆芽菇的柄上及料面老根上长出许多新的原基。当新原基长至l-2厘米时，拉高袋口至离料面5厘米，继续适当通风，进行抑蕾处理。待菇体长至与袋口平时，拉直袋口，并在袋口上盖纱布或报纸，经常喷水，使覆盖物处于湿润状态。待菇柄长至12厘米时，加强通风，使菇盖略干，柄变得硬实，这样的菇体外观好，耐贮藏，从菇蕾形成到采收需14-16天。
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