芹菜的生理性障碍有烧心、空心、叶柄开裂和缺硼症。以上生理性障碍严重地影响了芹菜的生长，降低了产量及品质。
一、烧心
1、症状。开始心叶叶脉间变褐、逐渐叶缘细胞坏死，呈黑褐色。在生育初期很少出现，多在11-12片真叶时开始发生。
2、发生条件和原因。烧心在高温、干旱、施肥过多的条件下容易发生。高温能加快生育速度，促进植物对氮、钾、镁等元素的过量吸收，从而影响对钙的吸收。而烧心是由缺钙引起的。在干旱条件下，由于根系对钙元素的吸收能力减弱，易引起植株缺钙，越是酸性土壤则发生越重。
3、防治方法。首先要避免高温干旱，进行适温适湿管理；对酸性土壤可施用消石灰调节到中性或接近中性；施氮、钾、镁等肥料要适量。一旦发生烧心症状，可用0.5%氟化钙或硝酸钙溶液向叶面喷雾。
二、空心
1、症状。空心是一种生理老化现象，发生的部位是叶柄，是叶柄髓部位和输导组织细胞的老化，细胞液胶质化失去活力和细胞膜发生空隙。多从叶柄基部向上延伸，在同一植株上外叶先于内叶，由叶基到第1节间发生较早。叶柄空心部位呈白色絮状，木栓化组织增生。
2、发生条件和原因。空心在沙性大的土壤中发生较多，进度也快；肥分不足或后期脱肥时也有发生；产品过熟和久藏失水、过量喷施赤霉素等，土壤干旱或温度过高、过低、芹菜受冻也易发生。
3、防治方法。应避免在沙性过大的土壤上栽培；除施足底肥外，在生长发育过程中要及时追肥，如发现叶片颜色转浓出现脱肥现象时，可用0.1%尿素液肥等进行根外追肥。用赤霉素处理时，应及时喷施氮肥。
三、叶柄开裂
1、症状。多数表现为茎基部连同叶柄同时开裂，不仅影响商品品质，而且病菌极易侵染，致使芹菜发病霉烂。
2、发生条件和原因。多在低温、干旱条件下，由于生育受到严重抑制所致。另外，在突发性高温、多湿的条件下，由于植株吸水能力过强，组织充水时也能发生。
3、预防措施。进行正常的适温、适湿管理，特别在温室内生产芹菜时，要加强保温措施；深耕土壤，多施有机肥，促进根系正常生长发育，增强其抗旱及抗低温能力。
四、缺硼症
1、症状。其表现为叶柄异常肥大、短缩，并向内侧弯曲，弯曲部分的内侧组织变褐、逐渐龟裂，叶柄扭曲以至劈裂。发展顺序是：由幼叶边缘向内逐渐褐变，最后心叶坏死。
2、发生条件和原因。一是由于土壤中缺硼所致，二是土壤中其他营养元素偏多，而抑制了对硼的正常吸收。另外在高温干旱的条件下也易发生缺硼症。
3、防治方法。如果土壤中缺硼，每亩可施用硼砂1千克，以补充硼元素的不足；发现缺硼症状后，可用0.1%-0.3%硼砂水溶液进行叶面喷雾。
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