微生物农药也属于生物农药的一类，是由细菌、真菌、病毒等活体微生物防治蔬菜病虫草害的一类农药，不包括各类农用抗生素。微生物农药同样具有毒性较低、对天敌生物安全、对环境友好等优点，是生产无公害农产品优先选用的农药品种。
 1．病毒类微生物农药
目前发现对昆虫有致病力的病毒有300多种，可使200多种鳞翅目害虫感染带毒，常用的病毒有三种：
（1）核形多角体病毒。喷在植物上，被昆虫取食后，经胃液消化，游离出棒状病毒粒子，通过胃（肠）皮细胞进入体腔，在昆虫细胞核内复制增殖，感染病毒的昆虫约10天左右即可死亡。
（2）质形多角体病毒。喷在植物上，被昆虫食后，在昆虫的细胞质内形成圆形病毒粒子，被感染的昆虫，约10—20天死亡。
（3）颗粒病毒。喷在植物上，被昆虫食后，约4—5天死亡。
2．真菌类微生物农药
(1)白僵菌也是应用较多的一类微生物农药，可用于防治白粉虱、烟粉虱、蛴螬等多种害虫，非常适合保护地害虫防治。
(2)木霉菌可用于防治黄瓜灰霉病和霜霉病、西瓜立枯病和青枯病等。
3.细菌类微生物农药
(1)苏云金杆菌(Bt)是目前应用最为广泛的品种，占到全部微生物农药使用量的绝大部分，可用于防治小菜蛾、菜青虫、甜菜夜蛾、斜纹夜蛾、茶毛虫、茶尺蠖、棉铃虫、玉米螟、苹果巢蛾等多种鳞翅目害虫。
(2)多粘类芽孢杆菌可用于防治番茄、辣椒、茄子青枯病。
(3)枯草芽孢杆菌可用于防治黄瓜白粉病、草莓白粉病和灰霉病等，还可用于调节蔬菜生长、起到增产作用。
据了解，目前的微生物农药以杀虫剂为主，真菌中的苏云金杆菌（Bt）、细菌中的白僵菌以及病毒类制剂都是针对昆虫尤其是鳞翅目昆虫，只有少部分的是针对病害，比如细菌类的芽胞杆菌和真菌中的木霉菌。
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